Возможно ли таможенные платежи указать в договоре, как расходы поставщика?

Да, например, при использовании условий поставки DDP («Delivered Duty Paid» — поставка с оплатой пошлин) ответственность за доставку и уплату всех импортных пошлин полностью ложится на продавца. При этом товар передаётся покупателю уже там, где все таможенные формальности выполнены и пошлины оплачены.